分子科学学报

2013, v.29;No.134(06) 505-514

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生物大分子全量子力学方法:显性极化(X-Pol)模型
Full quantum mechanics method for biological macromolecules: the explicit polarization(X-Pol)model

王英杰;刘梅怡;高加力;

摘要(Abstract):

显性极化模型(X-Pol)是片段化的量子化学方法,准确描述了体系中的静电相互作用及极化效应,可以用来研究分成片段的溶液或者生物大分子体系.本文介绍了X-Pol模型向多尺度电子结构方法组合的扩展,以及在Gaussian09程序中的实现.应用X-Pol模型,本文研究了两个氢键复合物的分子间相互作用.同时介绍了基于X-Pol模型在半经验方法层次上进行的水溶液中的牛胰胰蛋白酶抑制剂蛋白(BPTI)分子动力学模拟.

关键词(KeyWords): 极化作用;多尺度量子化学计算;氢键作用研究

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): National Science Foundation(CHE09-57162);; National Institutes of Health(GM46376)

作者(Author): 王英杰;刘梅怡;高加力;

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